菠萝蛋白酶广泛存在于菠萝的果实、芽、叶、茎中，从菠萝的果实中提取的称为菠萝蛋白酶，从菠萝的茎中提取的茎菠萝蛋白酶。它水解蛋白的活性比木瓜蛋白酶的活性高10倍以上，因此有着广泛的用途。
因此，如何对菠萝蛋白酶进行浓缩分离是很重要的。传统工艺：有机溶剂沉淀法，单宁沉淀法和高岭土吸附法。生产工艺周期长，菠萝汁容易变质。会使产品比活力不高；而且操作都比较复杂，原料消耗量大，酶活力的总收率低。如果，运用了超滤技术，情况就会大大的不同。
超滤法是膜分离技术中典型的一种，用超滤浓缩后的浓缩液，可大大节约辅助原料的用量，简化了工艺流程，总生产成本减少。而且产品质量好，使用寿命长，性价比高。纯度高，酶活力高，酶活力的总回收率高，抗污染性能好，使经济效益明显比传统工艺好。
超滤浓缩后的浓缩液，要用有机溶剂沉淀法来提取精酶，由于需要低温而使生产成本上升，但产品质量、纯度、酶活力都优于传统工艺，是菠萝蛋白酶升级换代的新工艺。
