在生物制药中，膜分离技术常被用于分离、浓缩、分级与纯化生物产品，根据目标产品不同，用的膜分离技术组合也有所不同。
1、膜分离法在生物产物的回收和纯化方面的应用：
细胞培养基的除菌
发酵或培养液中细胞的收集或除去
细胞破碎后碎片的除去
目标产物部分纯化后的浓缩或滤除去小分子溶质
产品的浓缩和脱盐。
2、膜法菌体分离的特点：
利用微滤或超滤技术操作进行菌体的错流过滤分离是膜分离法的重要应用之一。与传统的滤板过滤和硅藻土过滤相比，错流过滤法具有如下优点:
①透过通量大
②滤液清净，菌体回收率高
③添加助滤剂或絮凝剂，回收的菌体纯净，有利地进一步分离操作。
⑤易于进行无菌操作，防止杂菌污染。
膜分离技术具有设备简单，操作方便，无相变、无化学变化，处理效率高和节能等优点，随着制膜技术、组件结构及设备研制方面的进一步发展。使膜分离技术在生物制药生产中大规模应用成为现实。
