发展膜分离技术对于促进食品发酵工业节能减排，实现现有食品制造、发酵工艺的绿色改造具有重要意义。
作为食品制造工业，利用膜分离技术，可通过膜分离对微生物的滤除作用，来制造低温无菌食品，以减少传统热杀菌或机械杀菌对食品风味和营养成分及食品物质结构的破坏程度，如用膜技术生产低温乳制品和果蔬汁等。同时，也可以提升食品加工业的整体技术水平和科技含量，减少资源的浪费和污染物的排放总量。
作为以粮食为原料的发酵工业，其污染的产生是由于在微生物发酵中产生的副产物以及粮食中未被利用的成分，在提取产品时，作为废物排入水系而成为污染源造成的。膜分离技术利用物理截留原理，将这些副产物、菌体蛋白过滤回收，使发酵废水各项指标符合国家标准，同时又不在排水中引入新的污染源，是一种清洁的发酵废水排放处理手段。
发展膜分离技术对于分离精制发酵目标产品，提高产品纯度和市场竞争力，丰富功能性发酵产品市场，具有积极的促进作用。我国已经是发酵工业大国，味精、抗生素等多种发酵产品产量已位居世界首位，但在高纯度产品，尤其是酶制剂、功能性淀粉糖等方面，膜技术是分离纯化的有效手段，所以在发酵行业中推广应用膜技术将有力地推动高端发酵产品的国际化。
