(1)沉淀法沉淀法是指向废水中加入某些化学物质，与废水中的污染物发生化学反应，从而产生沉淀，分离、滤除杂质以到达净化的作用。与吸附法相比两者都具有沉淀的作用，但沉淀法是一个产生化学变化的方法，其中最为关键的就是尽量减少新物质的引入，如废水中的砷一般与铝盐沉淀剂(一般为硫酸铝、硝酸铝等)反应生成AlAsO3、AlAsO4等化合物沉淀。王莘淇使用磷酸铵镁沉淀法处理废水，研究表明在适宜的pH环境下清除PO43-达90%，清除NH4+达15%，投加晶种后清除率可提高20%。沉淀法操作简单，而且所需成本不高，但是由于沉淀物的处理方法过少，分离后有可能造成二次污染。具体联系污水宝或参见http://www.dowater.com更多相关技术文档。
(2)氧化法氧化法是指利用一些金属离子在某价态时不稳定，加入某些氧化剂将其氧化成稳定价态从而使其沉淀并滤除。此法安全性强，但有些氧化剂的价格较高，且选择面较窄，提高了去污的成本，使用时综合考虑。氧化法一般不单独应用，常与沉淀法合用。在郑春芳等人在阿托伐他汀制药废水研究中，主要使用了两种方法，分别是氧化法与氧化-混凝沉淀法(沉淀剂为聚丙烯酰胺、聚合氯化铝、氯化铝)，这两种方法对于COD的清除率分别为85%、35%，总清除率高达91.4%，实验结果表明加入沉淀剂后清除率有较大的提高。
吴建新采用高铁酸盐处理制药废水时发现:高铁酸盐为一种强氧化剂，除氧化作用外其对铁离子还具有吸附絮凝的作用，实验结果表明高铁酸盐直接处理废水的效果不太理想，清除率仅为30%，如果用于生化处理出水时清除率可达33%，可使生化性得到些许改善。