在生物农药生产中，如何有效地分离和浓缩具有生物活性的组分是提高产品价值，降低成本，增强市场竞争能力的关键。微滤、超滤等膜分离技术因其具有能保持被分离物质生物活性及回收率高、选择性好、能耗低等特点，特别适合于分离浓缩蛋白质和其水解液中酶、多肽和氨基酸、抗生素、中草药以及维生素等这些热敏性生物药品而越来越受到人们的重视。
超滤技术替代传统的板框压滤。其大的特点是在不需要加入助滤剂、絮凝沉淀剂及其他任何化学试剂的情况下，不仅可把菌丝体及其他固体杂质完全分离，而且可以把99%以上的蛋白(包括可溶性的蛋白)与菌丝体一起剔除，得到澄清的超滤滤液。
小分子超滤技术替代传统的离子交换过程。将超滤滤液中的色素、多糖去除，得到淡黄色澄清溶液。纳滤技术用以替代传统的薄膜蒸发器。在达到浓缩目的的同时，去除了小超滤滤液中的单糖及无机盐，此操作过程是在常温下进行，避免了由于过热所带来的宁南霉素效价损失。由于纳滤透析液中只含有微量的无机盐，可以返回发酵罐作为下一批发酵配料用，实现了闭环式的生产工艺，没有废水排放符合环保要求。
