生物法是利用微生物来还原或氧化印染废水中的染料分子，实现对染料的脱色，被认为是一种环境友好型的印染废水处理技术，具有运行稳定、处理费用低、操作简单、不易产生二次污染等特点。目前微生物脱色染料废水的研究主要集中于筛选和驯化高效降解和吸附染料的菌株，以及采用分子生物学技术构建基因工程菌强化菌株对染料的脱色能力。目前多种微生物已被报道具有染料脱色效果，如丝状真菌、酵母、细菌及藻类都具有染料脱色能力。
目前已报道的具有脱色能力的真菌有很多种，不同的菌株脱色机制不同，主要分为吸附脱色和降解脱色。具体联系污水宝或参见http://www.dowater.com更多相关技术文档。
.1真菌的吸附脱色真菌的菌体多呈丝状，易于形成疏松多孔的结构，因此可用于吸附印染废水中的染料分子。与微生物降解过程相比，真菌的吸附作用对染料分子结构的选择性较低，可以应用于多种染料的脱色。SUMATHI发现Aspergillusfoetidus通过生物吸附对染料溶液的色度去除率达到95%，对多种染料混合液后的去除率也能达到85%。BAYRAMOGLU等]的研究发现Trametesversicolor经过高温灭活处理后，对于偶氮染料直接蓝1和直接红128的吸附效率明显提高，说明该脱色过程主要为生物吸附作用。利用真菌菌丝吸附染料，虽然能有效脱色染料废水，但不能对其进行降解，且菌丝的回收难度大，易造成二次污染。因此利用真菌降解机制脱色染料更具优势。
.2真菌的降解脱色真菌降解染料主要是通过产生一系列的生物酶实现的，主要包括木质素过氧化物酶(LiP)、锰过氧化物酶(MnP)、漆酶(Lac)等。目前对白腐真菌降解偶氮染料的机理研究的最为透彻，但利用霉菌和酵母脱色偶氮染料的研究相对较少。KHELIFI等发现漆酶和木质素过氧化物酶是Aspergillusalliaceus脱色刚果红的关键酶。