1生物化学法：生物化学法指通过微生物处理含重金属废水，将可溶性离子转化为不溶性化合物而去除。硫酸盐生物还原法是一种典型生物化学法，该法是在厌氧条件下硫酸盐还原菌通过异化的硫酸盐还原作用，将硫酸盐还原成H2S，重金属离子和H2S反应生成溶解度很低的金属硫化物沉淀而被去除，同时H：S04的还原作用可将S02—4转化为S2—而使废水的pH值升高，从而形成重金属的氢氧化物而沉淀。中国科学院成都生物研究所从电镀污泥、废水及下水道铁管内分离筛选出35株菌株，从中获得高效净化Cr(VI)复合功能菌。
袁建军利用构建的高选择型基因工程菌生物富集模拟电解废水中的汞离子，发现电解废水中其他组分的存在可以增大重组菌富集汞离子的作用速率，且该基因工程菌能在很宽的pH范围内有效地富集汞。但高浓度的重金属废水对微生物毒性大，故此法有一定的局限性，不过，可以通过遗传工程、驯化或构造出具有特殊功能的菌株，微生物处理重金属废水一定具有十分良好的应用前景。具体联系污水宝或参见http://www.dowater.com更多相关技术文档。
2生物絮凝法：生物絮凝法是利用微生物或微生物产生的具有絮凝能力的代谢物进行絮凝沉淀的一种除污方法。生物絮凝剂又称第三代絮凝剂，是带电荷的生物大分子，主要有蛋白质、黏多糖、纤维素和核糖等。目前普遍接受的絮凝机理是离子键、氢键结合学说。前述硅酸盐细菌处理重金属废水可能的机理之一就是生物絮凝作用。目前对于硅酸盐细菌絮凝法的应用研究已有很多隋吲，有些已取得显著成果。运用基因工程技术，在菌体中表达金属结合蛋白分离后，再固定到某些惰性载体表面，可获得高富集容量絮凝剂。MasaakiTerashima等利用转基因技术使E.coli表达麦芽糖结合蛋白(pmai)与人金属硫蛋白(MT)的融合蛋白pmal-M1并将纯化的pmal-MT固定在Chitopeara树脂上，研究其对Ca2+和Ga2+的吸附特性，该固定了融合蛋白的树脂具有较强的稳定性，并且其吸附能力较纯树脂提高十倍以上。