反渗透浓水中的有机污染物主要来源于市政污水或工业废水处理系统的二级出水，这些有机物主要为小分子难生物降解的有机物。目前对于反渗透浓水中的有机物去除的研究主要分为两种方法：物理化学法和高级氧化法。
物理化学法：混凝沉淀混凝沉淀的主要对象是 废水中的细小悬浮颗粒和胶体微粒，通过向废水中投加混凝剂，使细小悬浮颗粒和胶体微粒聚集成较粗大的颗粒而沉淀，使有机物与水分离，废水得到净化。采用FeCl3对反渗透浓水进行处理，在FeCl3的用量为1.0mmol/L时，DOC的去除率只有26%。通过试验表明铁离子混凝能够有效去除色度(去除率为79%)，DOC和COD的去除率分别为34%和49%。采用FeCl3和Al2(SO4)3·18H2O2作为混凝剂处理反渗透浓水，试验结果表明FeCl3对有机物的去除效果较Al2(SO4)3·18H2O2好，DOC的去除率达到52%。由于水质不同，采用混凝处理效果也不同。具体联系污水宝或参见http://www.dowater.com更多相关技术文档术文档。
活性炭吸附：活性炭由于其发达的微孔结构和巨大的比表面积，能够有效吸附废水有机物，对色度和COD都有很好的去除效果。采用不同剂量的颗粒活性炭对浓水进行吸附处理，在活性炭量为5g/L时DOC的最高去除率可达91.3%。张叶来等[7]采用粉末活性碳/GAC对反渗透浓水进行预处理，系统出水的COD从70mg/L降至30mg/L。顾平等[8]对粉末活性炭对反渗透浓水吸附模型进行了研究，结果表明PAC投加量为0.9g/L，吸附时间为50min时，COD的去除率为69.7%。虽然活性炭对有机物有高的去除率，但是这需要大量的活性炭再生，因此，活性炭吸附不是长期运行经济有效的处理方法。赵春霞等[9]采用PAC吸附和MF膜过滤联合，开发了一种两阶段逆流吸附工艺。累计两阶段累计逆流吸附系统所需要的PAC剂量为0.6g/L，当稀释因子为0.1时，COD和DOC的去除率分别设定为70%和71%，活性炭的消耗量是常规的吸附工艺所需活性炭的剂量的42.8%。用少量的PAC可以很好的去除有机污染物。这种结合技术将污水回收率提高到91%～93.8%，具有很高的经济和环境效益。