DAT-IAT工艺基本操作运行程序如下：
⑴进水：污水连续进入DAT池经连续曝气后，通过DAT池与IAT池之间导流设施进入IAT池。DAT池不直接排放处理水，因此不像连续进连续出水的活性污泥法容易受负荷变化的影响。
⑵反应：反应工艺分两部分进行。首先发生在DAT池，该池在连续进水的同时连续曝气。去除有机物的机理和操作与连续流活性污泥法相同。反应工序的第二部分发生在IAT池，经DAT池初步生物处理的污水连续进入IAT。按工艺设置进行一定时间的曝气以达到好氧的目的。
⑶沉淀：沉淀工序仅发生在IAT池。当IAT池停止曝气以后，活性污泥絮体开始重力沉淀和泥水分离。IAT池的沉淀工序相当于连续流活性污泥法中的二次沉淀池功能。
⑷排水：排水工序只发生在IAT池。IAT池池水位达到最高水位，并经过沉淀工艺以后，上清液由设置在IAT池末端的滗水器缓慢排出池外。当池水位达到处理周期开始时的最低水位时，停止滗水。
⑸闲置：在IAT池沉淀后到下个周期开始期间可视污水的性质设置一闲置期，在该时间段内可根据需要进行搅拌或曝气。在厌氧条件下搅拌比好氧条件下的曝气要省能量，同时对保持污泥的活性也是有利的。在以脱磷为目的的装置中，剩余污泥的排放一般是在闲置工序之初和沉淀工序的最后进行。
DAT-IAT池去除的COD总量较常规法高，因为IAT系统是在非稳态条件下运行，经历厌氧、缺氧、好氧阶段，IAT池内生物相当复杂，微生物种类丰富，可通过多种途径代谢，使有机物降解更完全。