微生物法：微生物法处理酿酒废水就是在适宜的降解条件下利用已经培养驯化好的废水降解菌，对废水中有害物质进行高效率的降解的过程，从而降低废水中COD、BOD以及SS等的含量。黄武以水解酸化-UASB法对黄酒生产过程中产生的高浓度米浆废水进行了处理，这种方法是在酸化池中自然富集菌种，并对富集的菌种进行培养繁殖，以培养繁殖的酸化菌对酿酒废水进行处理。结果显示：解酸化池能够把浓度31500mg/L的COD降解为22150mg/L的COD，降解效果比较明显，而且酸化池还能有效的减少对厌氧消化的冲击，大幅度改善厌氧消化的效果，提高对酿酒废水的处理效率。黄钧等以酿酒废水为研究对象，研究厌氧-好氧工艺与微生物菌剂相结合的方法对酿酒废水COD浓度、BOD浓度的影响。实验前，酿酒废水COD浓度为8456.3~22442.0mg/L，BOD浓度为5040.0~9557.1mg/L，pH为3~4，经处理后，COD浓度降低到2000mg/L以下，BOD浓度降低到5800mg/L以下，pH变为6.16~7.11，综上所述：COD去除率达到91%~95%之间，BOD的去除率达到90%~94%之间，并且实验还表明曝气10~12h的微生物菌剂可保证出水COD浓度达到230mg/L以下，甚至直接达到国家一级排放标准。具体联系污水宝或参见http://www.dowater.com更多相关技术文档。
张欣等采用HUSB-厌氧消化-SBR工艺对小型白酒厂排出的酿酒废水进行了处理，他们在酸化池中对猪粪进行了培养驯化，使微生物充分富集在一起，用富集的细菌对酿酒废水进行降解。实验结果表明，使用HUSB-厌氧消化-SBR法后，COD去除率达到98%、BOD去除率达到92%、SS去除率达到90%左右。杨涛等以酿酒废水为研究对象，采用酿酒废水的活性污泥中分离出的紫色非硫细菌01S菌株对酿酒废水进行实验降解研究，实验中他们进一步培养以及纯化紫色非硫细菌01S菌株，并以此降解酿酒废水中的有机物。结果表明：紫色非硫细菌01S菌株在自然(或白炽灯)光照、pH值7.0、温度为28~30℃的条件下对酿酒废水的处理效率为82.2%左右，处理效果相对较好。
李杰等设计了一套酿酒废水的处理工艺流程，实验主要是在IC厌氧反应器中使用大量的厌氧微生物对酿酒废水进行厌氧降解，实验表明：在废水有效负荷为8.64kgCOD/m3·d、温度为35~37℃条件下,酿酒废水中的大量COD被微生物降解，COD的处理效率达到85%以上，出水达到《生活杂用水水质标准》(GB/T18921-2002)标准用水。总而言之，利用微生物法处理酿酒废水占地面积较小，而且一次性投资少，对小型白酒厂生产的废水的治理具有一定的借鉴意义，但是这种方法也有缺点，一般很难找到合适的降解菌种，即使找到了菌种也不易存活，而且微生物法对微生物菌种的调试时间过长，对实验条件要求比较苛刻，因此，微生物法处理废水还要进一步探索。