亚麻废水含有大量的木质素,果胶等生物难降解物质,生物处理后出水COD和色度均偏高。污水处理的主要对象是碱度、不易生物降解或生物降解极为缓慢的有机物质、染料色素以及有毒物质等。棉纺织物染色污水多采用好氧生物处理为主的处理工艺，纯棉织物染色污水采用好氧处理效果较好。针对该污水主要以染色污水、漂白污水为主，污水中含有大量的难以生物降解的物质等，单纯经生物处理后，一般达不到排放标准。
好氧生化处理工艺
1、碱度较高、悬浮物较少、色度高、CODcr居中但较难生化、含一定NH3-N和其它有色物质。
2、亚麻废水的排放具周期性，为保证后续各处理单元均能按最佳工况点运行，故必须设调节池均衡水量及水质，并通过曝气搅拌，降低部分CODcr 和色度。
3、因印染废水SS较低但pH较高，可不设初沉工序，但必须把pH首先调至中性，为后续生化处理作准备。
4、鉴于印染废水BOD5/CODcr较小，可生化性能差，因此必须设水解酸化工艺，即兼厌氧工艺，靠兼性菌使难生物降解的有机物水解为较易生物降解的短链有机物，改善可生物降解性能，提高全流程的去除效率。
5、采用好氧生化工艺，降低有机污染物：可采用的好氧生化工艺很多，如活性污泥法、生物滤池、氧化沟、SBR工艺及生物接触氧化法等。各工艺简介如下：
A、普通活性污泥法：主要特点是负荷中等，对污水冲击负荷有一定的适用性，但运行管理较为严格，易产生污泥膨胀等现象，抗毒物冲击能力不强，在印染污水中应用不多。
B、氧化沟法：属活性污泥法的一种变形，特点是处理水质好，污泥产率低，耐冲击负荷，具有部分除磷脱氮功能，管理方便，但占地面积较大，在印染污水处理中应用较少。
C、SBR工艺：是近年来发展起来的一种活性污泥新工艺，即间歇性活性污泥法，流程较简单，投资较省，出水稳定，国内在城市污水、制革污水等已有应用，但目前尚欠成熟，是一种很有发展潜力的污水处理工艺。
D、生物接触氧化法属生物膜法，微生物固定于池内的生化填料上，特点为充分利用填料的比表面积，可设计较高的 容积负荷，减少池容，减少占地面积，不存在污泥膨胀问题，有一定的耐冲击负荷能力，操作管理简单，出水效果稳定，产泥量小，在中、小型污水处理厂应用广泛，工艺稳定成熟，在印染污水处理中应用较多。
6、好氧生化处理工艺是全处理流程的核心，直接决定将来出水水质及其稳定性，而且它在总投资及运行费构成中所占比重较大，故应对各种生化处理工艺进行详细的技术、经济比较，选择最佳工艺方案。综合上述对各种生化工艺的比较根据本污水处理站的设计原则，确定好氧生化处理采用生物接触氧化工艺，采用推流式四级接触氧化，选用优质组合填料和鼓型微孔曝气头及日本进口SSR鼓风机，增加生物浓度，强化溶氧效率，确保取得理想的处理效果，最终达到要求的出水标准。好氧生化处理后必须设二沉池分离微生物新陈代谢产物和其它SS ，采用辐流式沉淀池，齿形堰出水。
水解酸化—SBR处理工艺
水解酸化池的作用是提高废水可生化性．这是难生化废水用生化法处理均需考虑的预处理过程。否则整个工艺的COD去除率难以保证。水解酸化池中存在厌氧、兼氧环境，使得产酸性厌氧、兼氧菌将水中结构复杂的大分子有机物分解为简单小分子有机物，将不溶性物质分解成可溶性物质．为后续好氧生化处理创造有利条件。SBR池中扁污泥活性、较高污泥浓度以及好氧、缺氧、厌氧状态交替出现的情况有利于难降解有机物的去除．因此，采用SBR法处理生物难降解有毒有害工业废水，COD去除率高于连续流活性污泥法。具体参见http://www.dowater.com更多相关技术文档。
传统的SBR工艺及活性污泥工艺相比，该水解酸化—好氧—SBR系统具有以下主要特点：采用连续进、出水；采用恒水位运行，避免了传统SBR变水位操作水头损失大、水池容积利用率低的缺点；大部分好氧处理集中到连续运行的好氧池中，从而需氧量也集中到该池，提高了设备的利用率；即可采用调整污泥回流比例的方式来控制F：M值旭可采用调整SBR各运行时段比例的方式进行控制，过程控制更加灵活；SBR池进水由该池的底部配水槽进入，穿过污泥层，污泥层起着接触过滤的作用，这与传统的SBR池不同。